【储存条件】
常温运输,室温(15~30˚C)保存,保质期一年。如需长期保存,可将各试剂组分置于 2~8˚C,使用时如发现结晶,可于 37~55˚C水浴加热助溶。离心吸附柱不建议低温或大于 30˚C保存,否则可能影响吸附效率。
【产品简介】
AFT胶回收试剂盒利用硅基质材料在高盐缓冲系统对 DNA 高效、专一吸附的原理,配备AFT自主研发的膜结合液(又称溶胶液)和高性能的硅胶膜离心吸附柱,可在 15 分钟内清除凝胶、核酸染料及其他杂质,高效回收 DNA 片段。本试剂盒配套的膜结合液和离心吸附柱的最大吸附量为 20µg,对 100 bp~10 kb 线性双链 DNA 片段的回收效率可高达50~90%,也可用于单链 DNA 片段和质粒 DNA 的纯化。因回收率受 DNA 片段大小、浓度等因素的综合影响,故应尽量加大电泳的 DNA 片段浓度,以提高回收率。回收后的 DNA 片段可以直接用于酶切、连接、测序、标记、杂交和体外转录等多种分子生物学实验。
【回收效率】
线性 DNA 片段大小 回收效率
50 bp 30~50%
100 bp ~ 200 bp 50~70%
200 bp ~ 5 kb 70~90%
5 kb ~ 10 kb 50~70%
【产品组份】
50T 注意事项
膜结合液(MB) 25ml
膜漂洗液(MW) 15ml 初次使用前请按瓶标说明加入无水乙醇混匀
洗脱缓冲液(EB) 10ml
平衡液(BL) 25ml 请使用当天平衡液处理过的吸附柱
离心吸附柱及收集管 50套 室温密闭干燥保存
初次使用本试剂盒,请按瓶标说明向膜漂洗液(MW)中加入相应体积的无水乙醇(用户自备),并在试剂瓶上做标记。
【实验准备】用户需自行准备的材料:含 DNA 样品的琼脂糖凝胶,无水乙醇,异丙醇, 55ºC 水浴,切胶设备,台式离心机。
【操作步骤】
柱平衡:向吸附柱中(吸附柱放入收集管中)加入400 μl的平衡液BL,12,000 rpm (-13,400×g ) 离心1 min,弃收集管中滤液,将吸附柱重新放回收集管中。(请使用当天处理过的柱子)
(请大家别嫌这步麻烦,它是为了盒子放置时间长不用,处理一下效果如新,减少浪费。如果新开封马上用,可以不做柱平衡)
1. 切胶。用干净刀片将目的DNA条带切下,尽量切除不含DNA的凝胶。
注意:紫外线对DNA片段有损坏作用,切胶要迅速,避免长时间照射,同时做好眼睛及皮肤的防护。
2. 称重。将切下的含有目的DNA条带的凝胶切成小块,放入1.5 ml塑料离心管中,称重。
注意:先称一个空的1.5 ml塑料离心管的重量,然后放入凝胶块再称一次,两次重量相减得到凝胶的重量。
3. 溶胶。加入等体积膜结合液(MB),60℃水浴,每隔2 ~ 3 min上下振荡,直到凝胶完全溶解。
注意:如凝胶重量为100 mg,其体积可视为100 ul,则加入100 ul膜结合液;如凝胶浓度大于2%,所用膜结合液体积加倍;对于回收<300 bp的小片段或者大于3000bp的大片段,必须在凝胶完全溶解后再加入1/2胶块体积的异丙醇以提高回收率;胶块完全溶解后最好将溶液温度降至室温再上柱,因为吸附柱在室温时结合DNA的能力较强。
4. 吸附。待溶液冷却后加入离心吸附柱中,室温静置2 min,让DNA片段与吸附柱中的硅胶膜充分结合,然后12,000 rpm离心1 min,弃收集管中滤液。
注意:如总体积超过750 ul可分2次将溶液加入同一离心吸附柱中;为增加目的DNA片段的洗脱浓度,也可将多管溶胶液加入到同一离心吸附柱中。
5. 清洗。加入600 ul的膜漂洗液(MW),12,000 rpm离心1 min,弃收集管中废液。
注意:膜漂洗液(MW)按要求加入乙醇,用后应立即盖紧瓶盖,以防酒精挥发; 如后续实验要求纯度较高,可再清洗一次。
6. 干燥。将离心吸附柱于12,000 rpm离心2 min,甩干残留漂洗液。
注意:此步不能省略,否则残留乙醇会影响后续实验。
7. 洗脱。将离心吸附柱置于一个新的1.5 ml塑料离心管中,在吸附柱中央加入30 ~ 50 ul洗脱缓冲液(EB),室温放置2 min。12,000 rpm离心1 min收集DNA片段。
注意:为增加回收效率,可将洗脱液在60℃预热,也可将得到的溶液重新加入到离心管中,室温放置2 min,再次离心收集。如需使用去离子水洗脱,可用NaOH调整其pH值在7.0 ~ 8.5之间)。
【常见问题及解决方案】
问题 | 可能原因 | 解决方案 |
回收效率低 | 膜结合液(MB)使用量不当 | 按每 1 mg 凝胶或每 1 µl DNA 溶液加入 1 µl 膜结合液的比例(1:1)加入膜结合液 |
溶胶不完全 | 尽量将胶切成小块,加入膜结合溶液后于 55~65℃加热助溶,确保溶胶彻底 | |
离心力不足, DNA 未与硅胶膜充分结合 | ≥12,000 rpm 离心,如果离心机达不到该转速,可适当延长离心时间以确保胶溶液完全通过硅胶膜 | |
膜漂洗液(MW)未添加乙醇 | 第一次使用时按比例添加乙醇,并在试剂瓶上做标记 | |
洗脱溶液 pH 值不合适 | 使用试剂盒提供的洗脱缓冲液(EB);如用去离子水洗脱,需将 pH 值调至 7.0~8.5 范围 | |
洗脱溶液体积过小 | 使用 30 µl 以上洗脱溶液,加至硅胶膜的中央,静置 1 分钟,使膜完全浸润后再离心 | |
回收产物测序结果不佳 | 用量太低 | 提高测序反应使用的DNA量;如果回收产物浓度过低,可通过乙醇沉淀浓缩产物 |
用量过高,干扰测序结果 | 降低 DNA 用量,必要时用 EB 或灭菌双蒸水进行稀释 | |
TE 缓冲液干扰测序结果 | 使用无 DNA 酶污染的洗脱缓冲液(EB)或灭菌双蒸水溶解 DNA 作为测序模板 | |
紫外线下暴露时间过长 | 切胶动作要快,尽量减少紫外线照射的时间 | |
酶切效果不佳 | 酶的质量低劣或使用方法不当 | 按照厂家说明书正确使用酶;设立阳性对照检测内切酶活性 |
膜漂洗液(MW)去除不彻底,胶回收产物中残留有乙醇或盐 | 再次乙醇沉淀回收,并确保 DNA 溶液体积不高于酶切反应总体积的 10% | |
电泳上样时漂出上样孔 | 未添加上样缓冲液 | 与适量上样缓冲液混合后上样 |
膜漂洗液(MW)去除不彻底,胶回收产物中残留有乙醇 | 确保洗涤步骤中洗涤缓冲液去除彻底,可增加离心时间或开盖放置一段时间使残留乙醇挥发 | |
回收产物电泳条带不锐利 | DNA 分子断裂 | 切胶、混合等操作尽量小心,特别是大片段,应避免 DNA 因机械损伤而断裂 |
其他 DNA 分子污染 | 使用新配制的琼脂糖凝胶和电泳缓冲液,刀片应保持清洁,以避免 DNA 交叉污染 | |
DNA 分子降解 | 切下来的胶块如不能及时回收,应于 4℃保存,避免 DNA 降解 | |
克隆效率低 | 离心吸附柱漂洗不彻底 | 再次乙醇沉淀回收 |
回收过程中有外切酶污染,导致DNA片段末端序列缺失 | 用新鲜配制的胶和电泳缓冲液进行电泳;胶回收保证无菌操作 | |
感受态细胞的效率差 | 确保感受态制备和保存方法正确 |