AFT Liquid Sample Total RNA Extraction Reagent (TRIgent LS替代品)

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AFT Liquid Sample Total RNA Extraction Reagent (TRIgent LS)   100ml   AFT2082-01

 

 

 

储存条件

 

TRIgent LS在室温下能稳定保存12个月。为达到最佳效果建议保存TRIgent LS2~8°C的环境下。

 

 

产品简介

 

TRIgent LS试剂是直接从来源于人,动植物,酵母,细菌和病毒的液体样品中提取总RNA的试剂。也可以从动物组织、 植物材料、 各种微生物及培养细胞等样品中提取总RNA 

 

该方法对少量的组织(50-100mg)和细胞(5×106)以及大量的组织(≥1g)和细胞(>107)均有较好的分离效果。样品在TRIgent LS中被充分裂解的同时能够最大限度地保证RNA的完整性。在加入氯仿离心后,溶液会分成三层:上层无色水相、中间层和下层有机相,RNA 分布在上清层中。收集上清层后,经异丙醇沉淀便可以回收得到总RNA

 

提取的总RNA完整性好,无蛋白和DNA污染,可用于各种分子生物学常规实验,如RT-PCRReal-time RT-PCRNorthern blotDot Blot、体外翻译等。

 

TRIgent LS试剂能促进不同种属不同分子量大小的多种RNA的析出。例如,从大鼠肝脏抽提的RNA琼脂糖凝胶电泳并用溴化乙啶染色,可见许多介于7kb15 kb之间不连续的高分子量条带(mRNAhnRNA成分),两条优势核糖体~5 kb(28S)~2 kb(18S),低分子量RNA介于0.10.3 kb之间 (tRNA, 5S)。当抽提的RNATE稀释时其A260/A280比值≥1.8

 

注意如果是普通琼脂糖凝胶电泳,28S的位置大约在2kb18S大约在1kb的位置,不同浓度的凝胶位置变化较大。

 

 

注意事项

 

1. 本品中含有苯酚,具有毒性和腐蚀性。如果吸入体内、接触皮肤、吞食等会导致中毒、灼伤以及其他身体伤害。使用本制品时应穿戴防护物品,如防护服装、手套、眼罩、面罩等。如果不小心接触,应立即用大量的水冲洗并前往医院治疗

 

2. 样品匀浆后,如果不即刻加入氯仿之前,,置于-70°C下可放置一个月以上。保存在75%乙醇中的RNA沉淀,2-8°C可以保存一周,-20°C条件下可以保存1年。RNA半衰期比较短,容易降解,建议提取后尽快进行后续实验,如反转录成cDNANorthern Blot等。

 

3. 若下游实验对DNA非常敏感,建议用 RNase free DNase IRNA进行处理。

 

4. 自备试剂:氯仿、异丙醇(新开封或提取RNA专用)、75%乙醇(DEPC处理过的水配制) RNase free water或者DEPC处理过的水。 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

操作步骤

<友情提示>

 

1) 抽提RNA时要戴手套和护眼罩。避免接触皮肤和衣服。

 

2) 在化学通风橱完成操作。避免呼吸道吸入。

 

3) 如无特殊说明,所有的操作应该在在15~30°C的室温条件下。

 

1. 匀浆

 

a. 生物液体:每0.25ml液体样品(血清,血浆,脑脊液等等)加入0.75ml TRIgent LS,用加样枪吹打液体样品几次以帮助裂解样品中细胞。每5~10×106个细胞至少加入0.75ml TRIgent LSTRIgent LS 和液体样品的终体积比总是3:1

 

b. 动物组织:用glass或强力匀浆器搅匀组织样品,每50~100mg组织或者0.25ml组织悬液加0.75mlTRIgent LS。一般50~100mg组织体积都要小于0.25ml,如果组织样品的体积小于0.25ml,加入灭菌水将组织样品体积调整到0.25ml以保证体积比例是3:1

 

c. 单层生长细胞:直接往直径3.5 cm的培养板中加入0.3ml-0.4mlTRIgent LS裂解细胞,用加样枪吹打帮助充分裂解细胞。依据培养板的面积而不是依据细胞的数量来决定所需的TRIgent LS量(每10cm20.3-0.4ml)。不需要往裂解物里面加水,因为培养板中附着残留的培养液已经充分稀释了TRIgent LS

 

注意:贴壁培养细胞往往不能完全从培养瓶(皿)脱落,这并不意味着裂解不完全,此时细胞膜实际已经完全破裂开,并已释放出RNA,继续做即可。

 

d. 细胞悬液:通过离心来沉淀细胞。在TRIgent LS试剂中用移液管反复吹打来裂解细胞。每5~10×106的动物细胞,植物或酵母菌细胞或每1×107细菌加0.75mlTRIgent LS。和步骤b一样用灭菌水调节样品体积到0.25毫升。在加入TRIgent LS前应避免洗涤细胞,因为那样会增加mRNA降解的可能性。破裂某些酵母菌和细菌可能需要使用匀浆器。

 

e. 植物组织:取新鲜植物组织在液氮中充分研磨或将植物组织剪碎后直接在TRIgent LS中迅速研磨,每50-100mg组织加入0.75ml TRIgent LS,和步骤b一样用灭菌水调节样品体积到0.25毫升,混匀。

 

2. 将匀浆样品剧烈震荡后在室温条件下放置5分钟以使核蛋白体完全解离。

 

3. 可选步骤: 4°C的条件下以12,000 rpm的离心力离心10分钟,取上清。

 

如样品中含有较多蛋白质,脂肪,多糖或肌肉,植物的块茎结节等可离心去除。离心后的沉淀中包含有细胞外膜,多糖,以及高分子量DNA,上清中含有RNA。处理脂肪组织的样品时,上层是大量油脂应除去。取澄清的匀浆液进行下一步。

 

4. 0.75ml TRIgent LS0.2ml氯仿。盖紧管盖,剧烈震荡15秒并将其在室温下放置2~3分钟。

 

5. 4°C 12,000 rpm的离心力高速冷冻离心10-15分钟。离心后混合物分成三层:下层有机苯酚氯仿层,中间层,上层无色的水样层。RNA无一例外地存在于水样层当中。水样层的容量大约为所加TRIgent LS容量的70% (有机层和中间层是蛋白和DNA,如果需要提取,请联系我们索取提取方法)。

 

6. 将水样层转移到一干净的离心管中,加入等体积异丙醇。 颠倒混匀后室温放置10分钟。

 

RNA沉淀在离心前通常不可见,离心后在管侧和管底形成胶状沉淀。

 

7. 在室温或者4°C 12,000 rpm 离心10分钟,弃上清。

 

8. 加入75%乙醇洗涤沉淀。每使用0.75ml TRIgent LS1ml 75%乙醇对沉淀进行洗涤。

 

9. 在室温或者4°C 12,000 rpm离心3分钟,弃上清,注意不要丢失RNA沉淀。

 

注意:剩余的少量液体可短暂离心,然后用枪头吸出,注意不要吸弃沉淀。

 

10. 室温放置2-3分钟,晾干。加入30-100μl RNase free水,充分溶解RNA,得到的RNA保存在-70℃,防止降解。

 

注意:沉淀不要过分干燥,以免难于溶解。

 

 

 

附注RNA 纯度及浓度检测

 

A、完整性 RNA 可用普通琼脂糖凝胶电泳 (电泳条件:胶浓度1.2%0.5×TBE电泳缓冲液;150v15 分钟)检测完整性。由于细胞中70%-80%RNA rRNA,电泳后UV 下应能看到非常明显的rRNA 条带。动物rRNA 大小分别约为5 kb 2kb,分别相当于28S 18S rRNA。动物RNA 样品中最大rRNA 亮度应为次大rRNA亮度的1.5-2.0 倍,否则表示RNA 样品的降解。出现弥散片状或条带消失表明样品严重降解。

 

B、纯度OD260/OD280 比值是衡量蛋白质污染程度的指标。高质量的RNAOD260/OD280 读数(10mMTris, pH7.5)在2.1-2.2 之间(100%纯的RNA比值一般是2.2左右,很多公司无法达到这个标准,所以1.9-2.0就凑合用了,但是我们的产品标准一般可以达到2.1-2.2)。OD260/OD280 读数受测定所用溶液的pH 值影响。同一个RNA 样品,假定在10mM TrispH7.5 溶液中测出的OD260/OD280 读数1.8-2.1 之间,在水溶液中所测读数则可能在1.5-1.9 之间,但这并不表示RNA 不纯。

 

C、浓度:取一定量的 RNA 提取物,用RNase-free 水稀释n 倍,用RNase-free水将分光光度计调零,取稀释液进行OD260OD280 测定,按照以下公式进行RNA浓度的计算:终浓度(ng/μl= (OD260)×(稀释倍数n)×40

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

 

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