【储存条件】 2-8˚C(避免太阳光直射)。
【产品组分】 AFT Gelred Plus核酸染料(10000X) 500μl
【产品简介】
AFT Gelred Plus核酸染料(10000X)是在Gelred基础上优化开发的一种具有凝胶染色特性,并被设计为替换高毒性染色剂-溴化乙锭(EB)的红色荧光核酸染色剂,比Gelred具有更高的清晰度和灵敏性。 因为Gelred Plus与EB有着相同的光谱特性,可以在不改变任何成像系统的情况下用来替换EB。
如果使用的是SYBR(如SYBR Green 1/SYBR Gold)染色剂,并使用紫外透射器(UV transilluminator)来观察凝胶,那可以使用 Gelred Plus替换SYBR染色剂,不需要更换现有的SYBR虑光片。然而,在488 nm 激光或类似可见光下 Plus不能被充分地激发,如果需要,建议您使用GelGreen染色剂(AFT2050),其灵敏度与SYBR Green I一样,但其稳定性和可靠性远胜于后者。
AFT Gelred Plus既可用于前染 (precast gel staining),也可用于后染 (post gel staining)。通常后染比前染能够获得更灵敏的特性,并能排除染色剂在电泳过程中对核酸条带分离造成任何影响的可能性。然而,前染较后染更为简单、经济,因为前染不需要额外的着色过程,并且染料用量更少。
另外,与GelGreen 、 EvaGreen 一样,相对EB或SYBR, Plus诱导突变的能力极低。 AFT Gelred Plus核酸染料, 10,000X in water为浓缩的 Gelred Plus溶液。用于前染时,可稀释10,000倍后使用;用于后染时,建议您稀释3,300倍后使用,见具体操作步骤。
【产品特点】
1. 安全无毒: 独特的油性大分子特点使其不能穿透细胞膜进入细胞内,艾姆斯氏试验结果也表明该染料的 诱变性远小于 EB。
2. 灵敏度高:适用于各种大小片段的电泳染色,对核酸迁移的影响较小。样品荧光信号强,背景信号低。
3. 稳定性高:适用于使用微波或其它加热方法制备琼脂糖凝胶;室温下在酸或碱缓冲液中极其稳定,耐光性强。而且不挥发!
4. 操作简单:在预制胶和电泳过程中不降解,可直接用可见光凝胶透射仪观察。
5. 适用范围广:可选择电泳前染色(胶染法)或电泳后染色(泡染法);适用于琼脂糖凝胶或聚丙烯酰胺凝胶电泳;可用于 dsDNA、ssDNA或 RNA 染色。
【操作步骤】
一、胶染法(前染法)(用法同EB)
1.按常规操作,制备琼脂糖凝胶,加入浓缩的10000X Gelred Plus, 使其在凝胶中的终浓度为1X Gelred(比如,制备100ml凝胶,加入染料10μl,可根据实际情况调整用量),轻轻摇匀,倒胶。
2. 因为非常灵敏,电泳过程中 DNA marker 上样量只需1-2ul,而不是EB电泳中的5ul,请严控DNAmarker上样量。
3. 按常规方法电泳,观测结果。
二、泡染法(后染法,具体方法见背面)
1. 按照常规方法进行电泳。
2.用dH2O将10000X Gelred Plus浓缩液稀释约3300倍到0.1M的NaCl中,制成3X染色液。(比如,将15μl 10000X Gelred Plus浓缩液和5ml 1M NaCl加到45ml dH2O中)。
3. 将凝胶小心放入合适的容器中,缓慢加入足量的3X染色液浸没胶。室温振荡染色约10-30min,最佳染色时间根据凝胶厚度及琼脂糖浓度不同而略有不同。对于3.5-10%丙烯酰胺胶,染色时间通常介于30min到1小时。然后观测结果。
【附录:后染胶标准操作流程】
核酸电泳后染胶因为污染区域小,污染操作可控,越来越得到实验室的接受和采用。
标准操作步骤(以配100ml 1%的琼脂糖为例):
1、 称1g琼脂糖,量取100m l 1xTAE(或1x TBE)电泳缓冲液, 依次倒入一个三角瓶中。
2、 在微波炉中化胶煮沸致琼脂糖完全融化。
3、 取出静置5分钟,待胶液温度降至50度,将胶液倒入制胶模上。
4、 20分钟后待胶完全成型,取出放入电泳槽。
5、 将PCR产物或者其他DNA样品和上样缓冲液混合,逐一上样。
6、 电泳20-30分钟,根据溴酚蓝位置判断电泳到合适时间,停止电泳。
7、 将跑完电泳的胶放入含有染料的液体中,染胶10分钟(如果胶厚适度延长时间)。
8、 取出胶,放入扫胶仪中观察结果。
染胶液的配置:180ml dH2O中加入20ml 1M NaCl,再加入10000x Gelred浓缩液 60ul。
染胶液的使用:配置好的染胶液可以重复使用很多次,直至染胶强度很低再重新配置。